Gene Runner(基因序列分析软件) 官方正式版v6.6

生物基因分析Gene Runner是一个专业的应用，为遗传学家和生物学家提供了可靠的工具，可以帮助他们进行基因分析提供方便。

软件介绍

Gene Runner 是一款专业实用的生物基因分析工具。它能够帮助实验室工作人员的基因进行数据模拟分析，让数据能够可视化提供我们查看，支持多种序列分析，您可以在一个界面上模拟不同组的序列，利用颜色以及图形的方式区别基因组的变化过程。

软件特点

1、查找：在此框中输入查询序列。查询序列可能包含IUPAC通配符。碱基或氨基酸总数显示在查询框右侧的框中。也可以使用shift+ins或ctrl+v键从剪贴板粘贴查询序列(打开对话框窗口时，不能使用菜单中的编辑粘贴)。这个发现只接受一个字母的氨基酸代码。在一个或三个字母的代码显示中可以找到合适的氨基酸。如果find以前用于当前序列，请键入以前搜索的文本。每个序列都有自己的查找内存。

2、标准是对在“查找：”框中输入的查询序列的正常搜索。用于简单搜索或核酸搜索，所有碱基/氨基酸必须完全匹配。

3、主题：当搜索设置为蛋白质时，单击向下箭头显示Prosite主题的下拉列表。有关prosite及其序列约定的说明，请参见下文。当设置为核酸时，将显示核酸基序列表。选择所需的主题。然后，Motif会自动输入find:框中。此特征允许识别TATA盒、AP1结合位点、N-糖基化位点等。

4、类型：确定执行的搜索类型：标准、主题或不匹配。

5、motif是在motif框中搜索查询序列，或使用prosite约定在find:框中输入的序列，请参见下文。蛋白质和核酸的基序可以以相同的惯例输入。注意：此搜索比标准搜索慢。

软件特色

基因的运动员是专业的应用旨在提供遗传学家和生物学家提供一个可靠的工具，可以帮助他们轻松地进行基因分析。

发现限制性位点

酶限制图方法位于更多方法菜单中，使您能够创建限制性映射。

在确定限制位点后，可以通过选择琼脂糖凝胶模拟命令来预测琼脂糖凝胶的限制性片段的电泳分离。在查看模拟凝胶时，您可以将光标移到任何片段上，以显示其范围、大小和限制切割每个末端的限制酶的头。

应用程序需要的格式文件所包含的遗传信息，然后可以使用“ORF分析”（开放阅读框）按钮，可以让用户设置优先核苷酸或氨基酸的大小，以及选择工作表的翻译。开放的ORF的项目后，用户可以对每个条目进行各种注释。

矩阵模式

这种方法，位于更多的方法部分，发现序列特征，如起始位点，剪接受体位点和剪接供体位点。矩阵模式是在单独的数据文件中定义，Gene Runner软件\矩阵式文件夹（MAC）。而由密码子预测方法确定的起始密码子是简单框架ATGs，矩阵模式方法考虑局部序列与预测功能的子集为ATGS起始密码子的目的。

允许你同步更新两个工作在相同的文件在任何或所有五lasergene应用在同一时间。这样的变化在一个应用程序将自动应用的两个相同的共享数据的其他应用程序。

开放和节省开允许你在任何序列文件的命名和保存应用以上文件的格式，这是usable市“任何的其他应用程序。

“限制性分析”功能的基因流道，用户只需检查的序列的一部分，通过进入优选的切位点。此外，他们可以分析所有的酶的类型或复发/非回文。此功能还提供了用户设置一个精确的分析区域和丢弃出挑的选项。